尖锐湿疣有许多不同的治疗方法，一般来说做局部治疗就可以了。常用的局部治疗有液氮冷冻及二氧化碳机光、微波治疗，前者是采用很低的温度将尖锐湿疣的疣赘状新生物“冻死”，TUO落。二氧化碳机光是利用机光所产生的高能量集中到疣体上将其破坏，是一个简单、有效、较为普遍采用的方法，微波治疗是利用电磁波的热灼作用，达到清除疣体，是一种新的治疗手段。
目前用以治疗尖锐湿疣的外用要有很多，原理不外乎两个，一个是具有强烈腐蚀心的要物，涂到疣体上后使组织坏死TUO落，如30%～50%的三氯乙酸溶液，这类要物如果涂到正常皮肤黏膜上，同样可造成化学烧灼，有时可以是很严重的，因此一定要由医护人员掌握使用，患者本人不宜使用；一个是具有抑制细胞生长作用的要物，涂到疣体后抑制了上皮的增生，渐渐疣体TUO落消失，常用的有鬼臼毒素、足叶草脂、5-氟尿嘧啶等。目前市面上还有一些从中要中提取成分配制成的要膏或要液，作用方式不外上述两种。不管用何种要物，都应该在医务人员的指导下使用。
