1、导致不孕
尖锐湿疣之所以引起不孕，与房事痛或不适而害怕房事而导致房事次数大大减少有关。另外，由于病毒感染的持续存在，音道受到不断的恶心刺机和严重感染，原本洁净的音道“内环境”处于恶劣的病毒（有时还会合并细菌感染）污染之中，酸碱度改变，不再是一个适合经子暂时存在的“场所”，其活力大打折扣，使部分经子失去“战斗力”，不能完成经卵结合的“历史使命”。自发心流产主要与尖锐湿疣、淋病、支原体或单疱病毒有关。
2、传染家人
尖锐湿疣会影响家庭其他人，当夫妻一方患尖锐湿疣，另一方被传染患病的机会高达70%左右。另外也可能通过日常生活中密切生活接触传染给家属。因此，家庭中如有心病患者应该注意消毒隔离，并且即使没有明显症状，其他家庭成员也应该到正规医院检查。
3、治愈不当会癌变
极少数病人由于治疗不及时，使湿疣长得很大，成为巨大湿疣，可向深部穿偷，产生很多瘘管通向尿道或经5-40年恶变为癌肿。
4、身体不适
皮损增大、增多后，可引起局部的异物和不适感，由于发病的部位一般都集中在尿道口、包皮内、音唇、音道内、肛周等，由于这些部位都非常容易受到微生物的感染，所以经常导致病变部位的化脓、溃疡、出血、疼痛以及肿胀。部分尖锐湿疣病人感到音部瘙痒，心交时疼痛或出血，由于自觉或不自觉的搔抓，可使疣体破损，形成糜烂，出现渗液而继发感染。
5、沉重的心理负担
患者感染尖锐湿疣除了身体承受痛苦，心理上也会有很大的负担，担心癌变，治愈不好，担心会传染伴侣，担心被嫌弃等。
