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扁桃体发炎有些是由于细菌和病毒所引起的。
一般来说，乙型链球菌为引起扁桃体炎主要致病菌。还有一些其他的球菌也会引起该病的发生，比较常见的有：葡萄球菌、肺炎双球菌以及流感杆菌等等，一般来说这些病原体存在人体的口腔及扁桃体内，不会引起该病的发生。但是人体在身体抵抗力下降的时候，这些病原体就会趁机而入，从而导致扁桃体炎的发生。
