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胚胎移植是一个非常简单的程序，也是一个非常关键的程序，一般不需麻醉。手术时妇女处于仰卧姿势。医生用一个音道扩张器暴露并清洗子宫颈，去掉子宫颈黏液后，检查子宫颈口的通畅状况。
然后，实验室技术人员将挑选好的胚胎吸进一条移植导管，递给医生，医生将移植导管通过子宫颈送人子宫，把含有胚胎的液体注色到子宫腔内。在这个过程中可以移植一个或多个胚胎。整个移植草作仅需几分钟。
移植后患者休息约1个小时即可回家。在移植后的2-4天内尽量休息，因为这是胚胎着床的重要时期。目前大多数医生边使用超声仪观察边进行移植胚胎，这样医生可以准确地掌握胚胎的移植位置，怀孕率也会明显地提高。
