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大多数人接种乙脑疫苗无不良反应，仅个别儿童注色后，局部注色部位皮肤出现红肿、疼痛，少数有发热，体温一般均在 38°C 以下，并伴有头晕、头痛等不适。一般 1-2 天内就会自己好转。
而随着接种次数的增加，出现皮疹、过敏心休克等并发症的几率也会增加，不良反应一般在注色后 10-30 分钟出现。
这些接种后的不良反应在7岁以上儿童加强注色时比较多见。一旦出现有皮疹等过敏现象时，一定要及时就医，否则严重者可能会导致呼吸困难，危及宝宝生命。
