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第一，会引起食管胃消化道黏膜的刺机损伤引起局部的炎症。
第二，有可能在做胃镜的过程中引起孩子出现恶心、干呕等表现。严重的时候可能会引起反流物窒息，相对来说是比较危险的。
第三，有可能会影响到孩子的食衣。短期的食衣可能会有所下降，孩子可能会伴有不同程度的腹痛等表现。
所以小孩子在做胃镜的时候，如果不能够配合，那么就应该选择无痛胃镜，在麻醉状态下给孩子做相关的检查。可以规避一些意外或者风险，比如反流物窒息，因为孩子在这种请况下出现恶心干呕的症状，相对来说是比较轻微或者少见的。
