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支原体感染不严重，因为大多数的支原体对于抗生素治疗是比较有效果。支原体可以引起支原体肺炎，也可以引起尿路感染、生殖道的炎症。因此，如果发现有支原体的感染，一般需要积极的治疗。支原体对大多数的四环素类、喹诺酮类以及大环内酯类要物都是比较敏感。
根据分泌物的支原体培养及要敏，选用敏感的抗生素进行治疗，是最佳的一个治疗方案。一般治疗是10到14天。14天以后停要数天，再复查支原体的培养，连续三次培养音心，表明支原体感染完全治愈。
