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支原体感染咳嗽的话需要吃一些对支原体病毒敏感的抗生素。当由支原体感染下呼吸道引起患者出现咳嗽时，例如支原体的支气管炎和肺炎的患者，多需要选择氟喹诺酮类的左氧氟沙星或莫西沙星，还可以口服大环内酯类的阿奇霉素或罗红霉素的抗炎治疗。
只有通过选择此些敏感的抗生素抗炎处理，通过足疗程的抗炎治疗才能更好的控制其感染的程度，从而缓解患者咳嗽的程度。当然对于支原体感染引起的咳嗽其咳嗽的程度多较为剧烈，患者还需要口服一些止咳要物，例如复方甲氧那明胶囊、咳必清、复方福尔可定口服液、复方甘草片等处理，但要注意，此时不建议口服青霉素类或头孢菌素类无效的抗生素。
