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肺炎支原体可引起支原体肺炎。因为临床上现在常见的肺炎，统计学包括临床指南都推荐要覆盖住链球菌和非典型致病菌，这里的非典型致病菌就包括肺炎支原体。但对于支原体的治疗，临床上一般普通的要物是不好使的，比如临床常用的头孢类消炎要物，对支原体治疗没有效果。所以对于支原体治疗临床上要选择特殊的要物，比如大环内酯类的要物，可以应用阿奇霉素或者氟喹诺酮类的要物，比如左氧氟沙星、加替沙星、吉米沙星或者莫西沙星。目前拜复乐(莫西沙星)是治疗非典型致病菌非常好的要物，而大多数请况下，非典型致病菌应用以上的抗支原体的要物都能够治愈。临床上治疗难度不大，一般也不严重。
