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不同病毒感染的脑炎造成的后遗症也不一样。
单纯心疱疹病毒感染的病毒心脑炎。这一部分的画着会有癫痫的后遗症，少数的患者有视力，听力下降的症状。严重的孩子肢体平衡也会受到影响。有的病毒心脑炎孩子有语言障碍，严重的连说话都有问题，大部分的患者会出现语言表达能力障碍。语言障碍可以慢慢的康复，只是需要我们在正规的机构治疗，还要家长和孩子坚持。
其他的病毒感染比如巨细胞病毒和风疹病毒，会侵犯孩子的身体器官。这种类型的病毒心脑炎有的会导致孩子大脑瘫痪，小脑畸形。主要的表现症状就是智力相对于普通孩子比较迟钝，还有运动障碍，临床检查会有脑积水的症状。
