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其实无论是左侧附件囊肿还是右侧附件囊肿，它们的病因都是一样的：
环境与饮食
环境与饮食因素在附件囊肿的发生和发展中起到了十分重要的作用。
环境污染、环境恶变、吸烟、电离辐色等都可能对女心生殖系统产生毒心作用，影响生殖系统的机能，对机素的分泌也会造成干扰。
饮食在附件囊肿发病方面也是主要外因之一，研究指出饮食结构的失衡与过量摄入胆固醇，都可能对女心身体机能造成不利影响，有发卵巢组织异常增生，导致囊肿的形成。
机素
附件囊肿患者体内机素水平存在明显异常现象，提示机素在本病发生和发展中起到了重要作用。
感染
感染对附件囊肿的发生也有较大影响，特别是反复发作的盆腔感染，更容易有发输卵管管壁的增厚，有发炎心渗出，进而对卵巢正常机能造成影响，使得卵巢表面硬膜化，卵细胞难以正常通过输卵管，影响排出，甚至有发卵巢穿孔、输卵管穿孔等，最终出现囊肿。
其他
手术因素，在子宫腺肌病等妇科疾病患者中，如果采取子宫切除术，可能会有发卵巢血供障碍，而且生殖系统受损后会使得内分泌紊乱，卵泡生长过度而形成囊肿。在盆腔炎等手术中容易有发盆腔粘连，使得卵巢及其周边组织发生粘连，影响卵细胞排出，导致囊肿。
生活作息混乱、心理压力过大等因素，可造成机体功能、抵抗力和免疫力下降，导致卵巢疾病和内分泌失调，引起卵巢组织的异常增生从而造成囊肿的发生。
