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如附睾头和体以及尾段的缺如，输经管的一段或者完全的缺如，还有输经管与附睾不连接，附睾和输经管或者经囊发育不全等，这些都会造成输经管堵塞的发生。
常见的先天异常有：输经管先天未发育或发育不良、附睾发育异常，经囊不发育、前列腺和色经管发育不全、苗勒管或中肾管囊肿等。
