远征外蒙
1912年2月12日清帝退位，3月15日袁世凯在北京就任临时大总统，这时候蒙古的各亲王在前清肃亲王的游说煽动下，纷纷独立，反对共和。1913年6月2日，民国政府裁撤通永镇总兵，改置蓟榆镇守使，驻开平，以王怀庆任之，同时授为陆军中将。6月28日袁世凯调王怀庆署多轮镇守使，命他征讨外蒙，并奉袁世凯密令秘密搜寻传国御玺，派军击溃了外蒙叛军，王部连有胜绩而收复有成，最后迫使外蒙政权取消独立改为自治。8月28日给予二等文虎章。9月10日，北洋政府令，“镇守使王怀庆到防未久，迭获胜捷，调度有方，谋勇兼备，应特授勋五位以奖殊勚”，地方稍趋安定，不料王部下统领高青山节外生枝，无端杀害蒙古甘珠尔活佛，由此再度机怒蒙古人复起战事，袁世凯迫于舆论，遂将高青山惩办，并将王怀庆降调闲置。1914年9月15日调任冀南镇守使。
总统心腹
1915年12月13日袁世凯称帝，23日策封王怀庆二等男爵。1916年6月6日袁世凯死，黎元洪、冯国璋相继上台做总统，王怀庆能随遇而安，对于任内一切事务都虚应故事。1918年2月11日，北京政府任命王怀庆帮办直隶军务。9月23日王怀庆授为将军府“庆威将军”名号。10月10日，徐世昌继任大总统，王怀庆为其旧部，受到重视，内调总统府高等顾问。1919年5月21日，步兵统领李长泰以学潮去职，徐世昌令王怀庆署理步兵统领。7月31日实任步兵统领。11月2日加陆军上将衔，20日晋给一等文虎章，时北洋军阀割据跋扈各自称雄，徐世昌以一文人充当光杆总统，号令不出都门，故调王怀庆扩充实力，拱卫京师，倚为心腹，从此王春风得意，平步青云。
1920年7月14日直皖战争爆发，20日皖系失败，22日徐世昌派王怀庆督办近畿军队收束事宜，皖系败军分别为直奉军改编。7月24日兼署京畿卫戍总司令，9月8日兼任中央陆军第十三师师长，他纵部下诬良为盗，并以失盗为名抢劫颐和园珍宝无算。10月10日晋授勋三位。1921年1月3日晋给一等大绶嘉禾章。1922年1月17日毅军统帅姜桂题病故，2月2日北京政府派王怀庆会办毅军事宜。4月28日第一次直奉战争爆发，5月3日奉军西路北击败，5日西路奉军退北京附近，被王怀庆缴械，直系战胜后控制了北京政局。5月28日王怀庆实任京畿卫戍总司令，29日兼任热察绥巡阅使兼热河都统、陆军第十三师师长，徐世昌为了加强实力，以巩固自己的统治地位，嘱命王怀庆在热河省招兵，督练八个混成旅的队伍，他在热河省大种鸦片来筹措军饷，并盗取行宫珍宝。6月2日大总统徐世昌被迫辞职，王怀庆以京畿卫戍总司令名义护送徐至天津，然后迎黎元洪复任大总统。10月10日被北洋政府授为陆军上将。
马桶将军
王怀庆是北洋军中老资格的将军，像曹锟、吴佩孚等人还在家乡吃老米的时候，他已经是北洋军的协统(旅长)了。虽然此公长期以来位不过师长，但由于多年担任北京卫戍部队的首长，民国风云，什么事都赶上过，所以在民国史上还算有点知名度。北洋诸将很多都有外号，有好听点的，像吴佩孚叫“秀才将军”，冯玉祥叫“基督将军”，也有难听的，比如唐生智叫“和尚将军”，孙殿英叫“盗墓将军”，曹瑛叫“茶壶将军”(茶壶即机院之杂役)，王怀庆就属于有不雅的外号的一位，人称“马桶将军”。
“马桶将军”跟马桶的确有亲和力，无论在什么地方，没有抢可以，没有马桶不行，一具漆红烫金上面写着斗大的“王”字的马桶总是不离左右。办公桌后面放的不是椅子，而是马桶，办公就在马桶上公干。行军打仗，得有一个班左右的人马抬着马桶随行。只要看到那只硕大而且鲜园的马桶，人们就知道这是谁的队伍了。攻山头的时候，他的士兵打着上书“王”字的大旗往上冲，他坐在“王”字的马桶上督战，别有一番景致。
王怀庆喜爱马桶，是因为有便秘的MAO病呢还是嗜臭如兰，我们不得而知，但是有一点是可以肯定的，此公在他的部下和北洋圈子里，并不像他心爱的马桶那样臭。王怀庆从1905年当协统(旅长)开始，到1924年随着直系军阀的倒台而下野(属于跟错了人，非统驭无方也)，在北洋高层混了近二十年，大旗不倒，比起他那些三五年就树倒猢狲散的同行来，简直可以称之为“长寿将军”了。这一点，说实在的，跟他的用人不无关系。
用人之术
王怀庆的用人之术，说起来其实也简单，就是非老实人不用，挑兵不要市井之辈，越是山乡的农民越受欢迎，要脚上有屎，手上有茧。这一点似乎跟曾国藩练湘军有点相似，其实不然，当年曾国藩虽然重乡农，是用书生带乡农，而人家“马桶将军”，却根本不要书生。进入民国之后，军官学校的毕业生一天天多了起来，其中不乏喝过洋墨水的，但王怀庆一个也不收，说是不好管也不好用，他提拔的人，无论张三李四，都是穿了军装的乡农。不管多么脓包，只要满足一个条件就行，就是所有的军官都得无条件地忍受他的打骂。王怀庆每当要提拔某个人的时候，往往会无缘无故地当众将此人痛骂折辱甚至给一通拳脚，如果此人逆来顺受，唾面自干，那么第二天委任状就到了。时间一长，这个套路部下都莫熟了，只要谁哪天无故挨了打骂，其他的同僚就会赶紧让他请客，因为接下来人家就升了。
在北洋军阀时期倒戈、背叛随处可见的请形下，王大将军的部队确实像他心爱的马桶一样，固若金汤，不仅没有倒戈的，连捣乱的都没有。只不过，这种军队是不能打仗的，充其量只配在北京城里给达官贵人看家护院，连看家护院也没有看好，因为当时的北京治安也不怎么样。
直系老将
1923年2月9日，曹锟电北京卫戍司令王怀庆，谓北京大学管理图书员李大钊设有秘密机关，由俄人供给费用，请侦查严办。4月26日，北京军警领袖冯玉祥、王怀庆、陆锦、薛之珩、聂宪藩等百余人包围国务院索饷，勒令财长刘恩源出立笔据，限下月分发一月份经费。6月7日，陆军检阅使冯玉祥、北京卫戍司令王怀庆、步军统领聂宪藩、警察总监薛之珩等借口内阁已辞，嗾使军警官佐五百余人向总统府索饷，迫黎去位，为曹锟贿选铺路。6月9日，冯玉祥、王怀庆等推颜惠庆组阁，迫黎元洪交出政权，并冯玉祥、王怀庆部军官向黎元洪宅索饷，所谓“国民大会”亦包围黎宅鼓噪，10日冯玉祥、王怀庆部军官向黎元洪宅索饷，所谓“国民大会”亦包围黎宅鼓噪，12日冯玉祥、王怀庆向黎元洪辞职，迫黎去职，13日黎元洪在无奈之下被迫离职。9月曹锟贿选大总统，王怀庆大力相助，向曹锟献烟土八千两，派出大批军警在会场周围布置森严，胁迫议员们必须选举曹锟为大总统，起了推波助澜的作用。11月14日，王怀庆被曹锟晋授将军府“靖武上将军”名号。
1924年7月1日辞热察绥巡阅使等职。9月15日第二次直奉战争爆发，17日王怀庆被任命为讨逆军第二路总司令，米振标为副司令，刘富有为前敌总指挥，负责进攻义州、北镇，辖两个师另四个旅，总兵力五万五千人。24日王怀庆差京畿卫戍总司令职，以旧上官聂士诚之子聂宪藩代理，王怀庆率部参加直奉大战。10月2日，第十三师部队与奉军一触即溃，吴佩孚派讨逆军副总司令王承斌赴承德指挥，令王怀庆出冷口进攻锦州，他迟迟前进，不敢与奉军交锋。10月23日冯玉祥发动北京政变囚禁曹锟，26日吴佩孚冒曹锟之名任命王怀庆为陆军检阅使兼西北边防督办，并代王怀庆等三十六人发讨冯通电，但前线直军溃败，大势已去。11月3日京畿卫戍总司令被撤消，11月11日热察绥巡阅使被裁撤，王怀庆军队全部被奉军收编，王怀庆回天津赋闲。
1926年4月17日吴佩孚任命王怀庆为京畿警卫总司令，23日王怀庆率毅军三旅入北京，24日齐燮元亦至，25日代表吴佩孚与奉方协商会议，商定王怀庆维持北京治安，但北京局势由张宗昌控制，王怀庆未有作为。9月22日王怀庆卸任回天津，25日张学良、韩麟春委第十军军长于珍接收王怀庆之北京卫戍司令部，奉军占领北京，王怀庆从此永离军政。1930年4月中原大战爆发，在四川的吴佩孚衣乘乱复出，5月17日王怀庆到北平为吴佩孚活动。
退隐津门
1937年7月日军侵占平津，王怀庆未出津门。他任京畿卫戍总司令时，曾接受日本天皇之宝星勋章，因此日本侵略军对他很是优待，日军师团长板垣征四郎曾请他担任伪京汉路治安军总司令的职位，他见当时时局不稳，未敢冒然就任，借故推辞，躲往天津，故而招致了日本军部对他的不满，前所盗取之古瓷、古玉、字画等无数珍宝被日军洗劫一空，王怀庆为此几乎神经失常。1945年8月抗日战争胜利之后，王怀庆意衣东山再起，但过去由于很少与国民党要人相拉拢，所以终未能如其再次出山之愿。1953年，王怀庆因患心肌梗塞症久治无效在天津病逝。
