作为一个不平等条约，《日韩合并条约》从签订开始就注定充满争议，日本方面认为这份条约是符合国际法的，而朝鲜方面则力主这份条约是无效的。那么，《日韩合并条约》究竟如何国际法吗？日本和朝鲜关于这份条约的分歧具体有体现在哪些方面呢？
日本方面认为，《日韩合并条约》签订时符合当时的国际法。日本外相冈田克也于2010年8月25日下午在日本外国特派员协会发表演讲后接受采访时表示：“日本政府认为当时合约是合法签订的”。
朝鲜民主主义人民共和国和大韩民国方面认为，《乙巳保护条约》和《丁未七款条约》本身属于在日本B迫下签订的条约，故而两个条约“缔结时就是无效的条约”，而在这两个条约基础上签订的《日韩合并条约》也属于无效，并且签约时大韩帝国皇帝纯宗李坧亦拒绝签名。事实上，就连纯宗的让与诏书上也没有署名，所盖的印也只是用于一般行政批文的“敕命之宝”而非国玺。韩国历史学家慎镛厦这样论述道：“日帝把1905年末经缔结的所谓《乙巳条约》以单方面缔结的条约颁行，侵夺韩国外交权，设立统监府，强夺韩国内政，因此在《乙巳条约》之后，凡日帝统监府认为与韩国缔结的条约，一概无效。与《乙巳条约》直接相关并在其影响下缔结的所谓《韩日合并条约》（庚戌国耻条约）也因之无效。”2010年8月22日，即《日韩合并条约》签订100周年之际，朝鲜祖国统一民主主义战线中央委员会在声明中对日本殖民时期的野蛮行径表示强烈谴责，认为《日韩合并条约》是完全无效的，并强烈要求日本对朝鲜所犯下的罪行真心道歉并进行彻底的赔偿。
