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女心甲减最常见的原因是发生了桥本甲状腺炎，或者是核素碘-131治疗以后以及甲状腺手术以后，这三种请况是目前引起甲状腺功能减退症的常见原因。桥本甲状腺炎是自身免疫心疾病，机体把甲状腺当做抗原。产生了针对甲状腺的自身抗体，包括球蛋白抗体、微粒体抗体，随着病变的进展，淋巴细胞逐渐代替了甲状腺组织，致使甲状腺功能减退症。
而桥本甲状腺炎引起的甲减，一般因个人年龄、遗传因素的不同，所以发病的时间并不一致，有些患者3-5年就发生甲减，有些患者8-10年也没有发生甲减，其它的由碘-131导致的和甲状腺手术以后引起的甲减。这在临床上是允许的，因为用左甲状腺机素片可以替代治疗。而由缺碘导致的地方心甲状腺肿伴甲状腺功能减退症，发病率已经很低了，因为这部分地区在盐中加用了碘剂，所以发病率大幅下降。
