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由于子宫内膜异位的位置不同，所以手术的方式也会有很大差异，如果女心是子宫内膜异位到腹壁，而形成的异位结节，这时的手术很小，因为只需要将腹壁切口切开，然后将异位结节清除，再将切口缝合即可。
如果女心是由于子宫内膜异位到卵巢上，而形成卵巢巧克力囊肿，一般都是做腹腔镜手术来进行切除，手术不大，术后恢复时间需要一周左右。
