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早期附睾结核要物治疗即可治愈。如果没治愈，出现局部干痨样坏死严重，累及睾丸，病变较大并有脓肿形成或要物治疗效果不明显，则可行附睾切除。
附睾局部硬节抗结核治疗无效，或在治疗的过程当中结节逐渐增大，可以手术治疗，附睾切除术前2周应用抗结核的要物，术后继续应用抗结核的要物达6个月左右。
若附睾有病变，病变靠近睾丸，则可连同附睾将睾丸部分切除。不过一般建议尽量保留睾丸。附睾切除后，经囊和前列腺结核多能逐渐愈合。
