事实上，朱标的新格与朱元璋完全相反，且过于儒雅，不够勇武，反而是燕王朱棣更合自己的脾气。但是朱元璋是个深谋远虑之人，朱标是嫡长子，为了维持王朝的稳固，朱元璋坚持立朱标为皇位继承者，并想以此为表率，杜绝皇位之争。
但朱元璋有点想当然了，皇位的有或实在是太大了!野心颇大、勇武过人的燕王朱棣，岂会甘心做侄子的臣子?而看似温文尔雅的建文帝，也绝不是省油的灯。建文帝自继位起，就对几位叔叔十分提防，并与手下的谋士密议削藩事宜。
朱棣自然是一位藩王，建文帝念其势大，于是先把刀伸向了其他几位叔叔。效果是显著的，周、代、岷、湘、齐诸王一一被削，湘王甚至被B自焚，其他几位老叔则都成了庶人。接下来就是最难啃的燕王朱棣叔叔了，建文帝斗志昂扬。
建文帝先是加强了对燕王的管制，接着便想方设法获得了燕王“谋反”的罪证，开始逮捕燕王。而朱棣则钻了祖训的空子，打着诛杀间臣，为国靖难的名头，誓师出征了。北方的许多将领多是朱棣的旧部，降者颇多，朱棣拿下多座城池。
这场血腥的军事对峙持续了三年。按说朱棣并不具备兵力的优势，经济上也拼不过中央，但是朱棣的领导能力以及军事才能却不是建文帝可比的。并且建文帝的谋士团多为儒生，纸上谈兵的居多，不是燕王朱棣的对手。建文帝渐渐不敌。
建文四年六月，燕军直B南京，谷王开金川门投降，燕军顺利进京。混乱中，皇宫内院起了大火，灰烬中有几具残骸，建文帝不知所踪。这几具残骸中有没有建文帝?不知道，也没必要知道。建文帝若不是死于其中，朱棣还怎么继位?
朱棣顺利地继了皇帝位，却不是从建文帝那里继位，而是继位于明太祖朱元璋。朱棣废除了建文帝的年号及其改革的制度后，开启了血腥大清洗。他将忠于建文帝的旧臣处以极刑(剥皮，下油锅等)，将他们的女眷充为官机，使其受尽凌辱。
朱棣是心狠手辣的，做事也十分残忍。朱棣登基时，命建文帝的谋士方孝孺，为其拟即位诏书。方孝孺不从，竟被朱棣灭了十族八百余人。第十族从哪里来?原来其亲友门生也被株连处决。所以，朱棣为何被称为明君呢?为什么不是暴君?
朱棣虽然残忍，但是在治国方面还是一套的。他改革吏治，建立了内阁制度的雏形;他把都城迁到了北京;他疏浚了会通河;他鼓励垦荒，实施惠民政策;他五次北伐蒙古;他南征安南;他编纂了《永乐大典》。这些都是建文帝是做不到的。
所以，历史上对于朱棣的评价大多是比较正面的评价，朱棣本身就是一个文武全才，宽严并济，不但会搞军事，搞经济还会搞政治，能够成为千古名君，是名不虚传的，明朝在朱棣的带领下，国力日强，江山稳固，百姓富足，郑和的七次下西洋，万国来朝，扬我国威，实乃盛世。
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