《龙门飞甲》讲的是在明代宪宗年里，臣官篡权，残害忠臣。豪侠赵怀安在解救忠良计划里面，把罪大恶极的东厂督主万喻楼一刀丧命，招来西厂督主雨化田，使出天底下格杀令。赵怀安等一路上逃遁到嘉峪关的龙门，消失不见于遮天盖地的黑沙尘暴中。
尘消风散后，西厂暗探、鞑靼商队等武林各路人马，再一次夜宿于龙门客栈这一家沙漠黑店。曾毁于火灾的龙门客栈里，性感的女老板已经离奇失踪，只余下逃过于劫的伙计们重起炉灶，痴等女老板回家。基本上被大家淡忘的边疆民宿客栈，再一次因缘际会地风云变幻，神秘进入客栈的风里刀的容颜，竟然和雨化田这般相像。对民宿客栈暗道了然于胸的吹笙女人凌雁秋，又是何许人？就在由雨化田率兵的西厂追兵赶到之时，地平线突掀起多条龙卷奇风，赵怀安横空而出，想要和雨化田一决成败。大漠风烟间，这场天下变色的正邪之战，将要开展。
