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一、形体大小不一
蛲虫和蛔虫形体大小有很大的区别，蛲虫的体形较小，一般在8~13毫米左右，而回头的体型则较大，一般在20~35厘米左右。所以从形体大小可以准确的判断属于蛲虫感染还是蛔虫感染。
二、寄生部位不同
蛲虫主要寄生于回肠下端、盲肠以及结肠等部位，蛲虫可以在整个肠道内生存;而蛔虫主要寄生于空肠、回肠等小肠之内。蛔虫的活动轨迹范围比较广，蛔虫虫卵刚孵化之后可以进入人体小肠段上皮等部位，之后随着血液循环会到达人体肺部，在肺部发育之后会到达咽喉部位，通过吞咽的作用再次回到肠部，二者的生活轨迹完全不同。
三、产卵方式不同
蛲虫不能在人体肠道内产卵，只能在感染者睡觉时顺着肠道爬行至肛门附近，在肛门周围皮肤产卵;而蛔虫则是主要在人体肠道内产卵。
四、并发症不同
蛲虫和蛔虫有发的并发症不同。蛔虫有可能会顺着肠道向上移动，而当进入胆道时会有发胆道蛔虫，感染者会感觉到局部疼痛明显;而蛲虫则主要寄生在人体盲肠等部位，有可能顺着盲肠进入到阑尾有发阑尾炎。
