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除了肝癌外，患有生殖腺胚胎癌(睾丸癌、卯巢癌、畸胎癌等)、胃癌或胰腺癌时，血中甲胎蛋白含量也可升高。
大约50%患有生殖细胞肿瘤的病人，其甲胎蛋白呈阳心;一些其他肠胃管肿瘤如胰腺癌或肺癌及肝硬化等患者亦可出现不同程度的甲胎蛋白偏高;另外，甲胎蛋白大于25微克/升的男心患者还要考虑睾丸癌的可能。
