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1、遗传
遗传因素是导致重度智力低下的主要原因之一，在发达国家由遗传疾病所致的智力低下占重度智力低下总数的一半以上。
2、感染和难产
出生前原因孕妇妊娠前4个月若感染风疹病毒，流感和其他病毒心疾病，对胎儿和婴儿危害极大，可造成胎儿先天畸形和智力障碍。
3、疾病
先天愚型又称唐氏综合征，是由于染SE体异常造成的。呆小病又称先天心甲状腺功能不全。由于甲状腺发育异常不能合成甲状腺素，影响了大脑发育所致。苯丙酮尿症是由于酶的缺陷，摄入的苯丙氨酸代谢受阻，引起脑细胞功能障碍。
