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婴儿需要补充益生菌一般来说有两个原因，一是提高免疫力，预防各种疾病的发生。二是可以促进消化，使得婴儿健康快乐地成长。
益生菌通常存在于婴儿的胃中，可以抵抗来自婴儿肠道的病原菌的入侵和定植。因为它们是强营养物质的摄取者，并紧紧附着在肠壁上。当肠道驻留足够数量的婴儿细菌时，有害细菌就没有安顿的地方了。益生菌产生的醋酸和Ru酸会增加肠道的酸度，进一步抑制不良细菌的生长。有助于保持婴儿的正常体重。
