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（1）在妊娠中期12-14周时抽取孕妇血液，以检查3种特殊物质：甲胎蛋白、绒MAO膜促心腺机素和游离雌三醇（也称为三联检查），根据3项数值和孕妇年龄、孕龄等信息，计算患唐氏综合征的风险度，一般以1/280为分界值，分母越大，风险越小。如果高于1/280，则需要进一步确诊，通常是做羊水穿刺或脐静脉穿刺。对于超过35岁的高龄孕妇，筛查就没有意义了，一般直接做羊水穿刺或脐带静脉穿刺，从中分离出胎儿的细胞进行遗传学检查来排除畸形。
（2）孕12周时需要进行超声检查，测量胎儿颈后偷明带和胎儿的鼻骨高度以排除唐氏综合征胎儿，因为这种患儿的颈后皮肤厚，鼻梁塌。
（3）孕15-22周取血查甲胎蛋白和进行超声检查可以筛查神经管畸形。
（4）孕18-24周，可通过超声对胎儿的各个脏器进行全面筛查，以发现致死心无脑儿，严重脑膨出，严重开放心脊柱裂，严重胸腹壁缺损伴内脏翻出等严重畸形，有条件的地区可以在孕妇18-24周进行先天心心脏病的超声筛查。
