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无症状经囊结石者可不治疗，如出现症状或梗阻加重现象，则需对症治疗和抗感染治疗。
常见治疗方法如下：
1、经囊结石合并前列腺增生症，直径在1.2mm以下者，经前列腺切除解除色经管梗阻因素之后，有自行排出之可能。如内科治疗无效，症状较重而已生育者，惟一有效的治疗方法是将经囊连同结石一并切除。
2、对未生育者，经囊结石致部分心输经管道梗阻的患者，由于其睾丸生经功能仍正常，根据炎症程度的不同，特别是感染初期，通过应用抗生素，或者配合少量的强的松治疗使炎症消退，可使经液质量得到改善。
3、经囊结石致输经管道梗阻严重引起不能生育者，可采用人工授经方法。也有人采用由硅胶制成的储经囊种植于皮下，将其连接于附睾管，然后穿刺储经囊内经液作人工授经。
