就算宝宝们的染SE体没有出现问题，双胞胎或三胞胎在大脑、心脏、膀胱，以及肝脏等方面出现出生缺陷的可能新也会比单胎宝宝多一些。另外，多胞胎也有可能出现脑瘫。最近一项针对一百多万新生儿的研究显示，双胞胎发生脑瘫的几率是单胞胎的4倍。不过，多胞胎宝宝出现出生缺陷的风险仍然很小。最近一项研究发现，平均每1000对双胞胎中会有35对有出生缺陷，而每1000个单胞胎中，有25个会有出生缺陷。
